Vandaag is een grote dag, want het is mijn eerste werkdag als Scientific Programmer bij TNO Kwaliteit van Leven / Universiteit Leiden. Ik ga samen met 4 andere developers verspreid over Nederland (Universiteit Wageningen, Utrecht WKZ, Amsterdam en Universiteit Leiden) een metabolics datawarehouse infrastructuur en applicaties opzetten binnen het Netherlands Metabolomics Centre.

Met behulp van Mass Spectrometers worden op diverse plekken in Nederland biologische monsters geanalyseerd op metabolieten. Metabolieten zijn moleculen die ontstaan tijdens de stofwisseling en sommigen zijn weefsel- en organisme specifiek. Een Mass Spectrometer meet de massa van moleculen (lipiden) in een sample, en dat levert een enorme hoeveelheid data (honderden MB’s per sample) op. Het doel is deze data op een gestandaardiseerde manier te analyseren, op te slaan in een datawarehouse, met daarbij de kwalitatieve informatie van de studie, en te analyseren en interpreteren.

Elke developer heeft, naast het opzetten van de datawarehouse, een eigen specialisatie. Zo zal er in Leiden bijvoorbeeld met name worden gekeken naar identificatie van de ruwe data, en mijn focus binnen TNO zal de biologische interpretatie en visualisatie van de data zijn, en zo ben ik weer terug bij mijn biologische achtergrond Ik ben erg benieuwd en ik heb zin om de uitdaging op te pakken!